{"id":26546,"date":"2012-05-18T21:41:55","date_gmt":"2012-05-19T02:11:55","guid":{"rendered":"http:\/\/piel-l.org\/blog\/?p=26546"},"modified":"2012-05-19T19:56:30","modified_gmt":"2012-05-20T00:26:30","slug":"cancer-de-piel-que-nos-dice-la-secuenciacion-del-genoma-del-melanoma-humano","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/piel-l.org\/blog\/26546","title":{"rendered":"C\u00e1ncer de piel: \u00bfQu\u00e9 nos dice la secuenciaci\u00f3n del genoma del melanoma humano?"},"content":{"rendered":"<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignleft  wp-image-26547\" style=\"margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;\" title=\"Patricia-Krentcil\" src=\"http:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-content\/uploads\/\/2012\/05\/Patricia-Krentcil.jpg\" alt=\"\" width=\"336\" height=\"252\" srcset=\"https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2012\/05\/Patricia-Krentcil.jpg 480w, https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2012\/05\/Patricia-Krentcil-390x292.jpg 390w\" sizes=\"auto, (max-width: 336px) 100vw, 336px\" \/>Los avances obtenidos a trav\u00e9s del proyecto genoma humano y sus extensiones<strong><sup>1<\/sup>, <\/strong>al igual que la aplicabilidad de tecnolog\u00eda de alta eficiencia, como por ej. el an\u00e1lisis de microarreglos<strong><sup>2<\/sup>, <\/strong>en la evaluaci\u00f3n de la expresi\u00f3n gen\u00e9tica de cualquier tipo celular, por ej. c\u00e9lulas neopl\u00e1sicas, han sido de gran ayuda en la generaci\u00f3n del conocimiento necesario para entender y poder establecer las bases gen\u00e9ticas del c\u00e1ncer.<\/p>\n<p><!--more--><\/p>\n<p>En la misma direcci\u00f3n, la bioinform\u00e1tica ha establecido nuevos algoritmos para agrupar esta informaci\u00f3n en distintos repositorios o bancos de datos, con el objeto de ser utilizada en diversos estudios multidisciplinarios que permitan la comparaci\u00f3n de distintas variables entre c\u00e9lulas normales y neopl\u00e1sicas para identificar expresiones gen\u00e9ticas comunes o diferenciales y su posible relaci\u00f3n con la enfermedad, o la identificaci\u00f3n de nuevos blancos terap\u00e9uticos, entre otras<strong><sup>3<\/sup>. <\/strong>\u00a0<\/p>\n<p>La secuenciaci\u00f3n a gran escala del genoma de c\u00e9lulas cancerosas y el an\u00e1lisis comparativo de estas secuencias (gen\u00f3mica comparativa) han sido enfocados, inicialmente, en la identificaci\u00f3n de genes potencialmente asociados a c\u00e1ncer producto de mecanismos que generan mutaciones (cambios en la informaci\u00f3n gen\u00e9tica). Los primeros estudios muestran que la tendencia de la tasa mutacional en algunos tipos de c\u00e1ncer es similar a las mutaciones que ocurren en las c\u00e9lulas germinales, donde las mutaciones por transici\u00f3n (cambios de una purina por otra o una pirimidina por otra) son m\u00e1s frecuentes que las mutaciones por transversi\u00f3n (cambios de una purina por una pirimidina o viceversa). El an\u00e1lisis de secuencias previamente publicadas, entre otras aquellas provenientes de c\u00e9lulas de c\u00e1ncer pancre\u00e1tico, sugiere que una buena proporci\u00f3n de mutaciones identificadas en regiones de codificaci\u00f3n de estas c\u00e9lulas son neutras y no est\u00e1n asociadas a ning\u00fan proceso de selecci\u00f3n<strong><sup>4<\/sup>.<\/strong> En otras palabras, no parece haber una selecci\u00f3n de mutaciones particulares para el desarrollo de este tipo de c\u00e1ncer.<\/p>\n<p>En un estudio reciente en melanoma,<strong> <\/strong>un c\u00e1ncer muy agresivo de las c\u00e9lulas de la piel llamadas melanocitos (c\u00e9lulas que dan color a la piel) asociado a la exposici\u00f3n solar<strong><sup>5<\/sup>,<\/strong> se presentaron por primera vez las secuencias del genoma completo de 25 tumores de melanoma metast\u00e1sicos, representativos de las formas cl\u00e1sicas descritas en este tipo de c\u00e1ncer (melanoma de extensi\u00f3n superficial, el l\u00e9ntigo melanoma maligno y el melanoma acrolentiginoso). La gen\u00f3mica comparativa entre estos genomas y el propio de la l\u00ednea germinal mostr\u00f3 una amplia variabilidad de la tasa de mutaciones entre estos distintos tipos de melanoma, encontr\u00e1ndose la menor tasa de mutaci\u00f3n en aquellos del tipo acrolentiginoso (3-14 mutaciones x 10<sup>6<\/sup> pares de bases). \u00a0Asombroso y de extrema importancia fue el hecho de encontrar una elevada tasa de mutag\u00e9nesis (~111 mutaciones x 10<sup>6<\/sup> pares de bases) en un melanoma proveniente de un paciente con exposici\u00f3n extrema al sol (radiaciones UV)<strong><sup>6<\/sup>.<\/strong> Varias de estas mutaciones contribuyen a la g\u00e9nesis y progresi\u00f3n del melanoma, aunque el mecanismo de c\u00f3mo ello ocurre no se ha establecido; estos resultados claramente confirman la contribuci\u00f3n que tiene la exposici\u00f3n al sol en la formaci\u00f3n de melanoma.<\/p>\n<p>El an\u00e1lisis de estas mutaciones muestra, en primer lugar, que muchas de ellas se generan por simple sustituci\u00f3n de nucle\u00f3tido, que en su mayor\u00eda incluyen transiciones del tipo C?T (Citocina?Timina) o G?A (Guanina?Adenina.; Las mutaciones de este tipo se presentaron en los genes BRAF y NRAS, previamente asociados a melanoma, al igual que en <em>PREX2<\/em><strong><sup>7<\/sup>.<\/strong> Otros cambios incluyen rearreglos inter- e intra-cromos\u00f3micos que muestran variaci\u00f3n en una amplia gama entre los distintos genomas de melanoma. Algunos de estos rearreglos cromos\u00f3micos generan amplificaciones sobre genes previamente asociados a actividad oncog\u00e9nica, tales como <em>ETV1<\/em> locus y <em>PREX2<\/em>. Muchas de las mutaciones identificadas por los autores son nuevas, por ej., algunas encontradas en el locus <em>PREX2. <\/em>Los autores sugieren que estos rearreglos pudiesen ser indicadores de genes de importancia funcional en melanomas; en el caso de <em>PREX2<\/em>, la relevancia funcional de algunas mutaciones se demostr\u00f3 en animales experimentales. Al parecer la \u201cadquisici\u00f3n\u201d de actividad oncog\u00e9nica de genes tales como <em>PREX2<\/em> podr\u00eda deberse a la perturbaci\u00f3n o inactivaci\u00f3n de una o m\u00e1s de sus funciones celulares producto del patr\u00f3n de mutaci\u00f3n. Queda claro que la comprensi\u00f3n de estas aberraciones gen\u00f3micas ser\u00eda de gran importancia para establecer la g\u00e9nesis y avance del melanoma, al igual que para la identificaci\u00f3n de nuevos blancos terap\u00e9uticos y la evaluaci\u00f3n de viejos y nuevos tratamientos para este tipo de c\u00e1ncer en t\u00e9rminos de efectividad y resistencia.<\/p>\n<p>\u00bfQu\u00e9 nos dice la gen\u00f3mica del melanoma? En primer t\u00e9rmino confirma la contribuci\u00f3n que tiene la exposici\u00f3n al sol en la formaci\u00f3n de melanoma. Segundo, revela una variabilidad de cambios gen\u00e9ticos generados por mutaciones puntuales y rearreglos inter- e intra-cromos\u00f3micos. Tercero, el patr\u00f3n de mutaciones en algunos genes, ej. <em>PREX2<\/em>, parece promover la adquisici\u00f3n de actividad oncog\u00e9nica.<\/p>\n<p>\u00a0<strong>Referencias.<\/strong><\/p>\n<p>Proyecto Genoma. <strong><\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Proyecto_Genoma_Humano\">http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Proyecto_Genoma_Humano<\/a>;<\/li>\n<li><a href=\"http:\/\/www.genome.gov\/10001772\">http:\/\/www.genome.gov\/10001772<\/a>;<\/li>\n<li><a href=\"http:\/\/www.sanger.ac.uk\/about\/history\/hgp\/\">http:\/\/www.sanger.ac.uk\/about\/history\/hgp\/<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>Microaarreglos:\u00a0<\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Chip_de_ADN\">http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Chip_de_ADN<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p>Hanauer et al. 2007. Bioinformatics approaches in the study of c\u00e1ncer. Current Molecular Medicine <strong>7:<\/strong>133-141<\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/www.benthamdirect.org\/pages\/timecorp_viewarticle.php\">http:\/\/www.benthamdirect.org\/pages\/timecorp_viewarticle.php<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p>Rubin, A. and Green P. 2009. Mutation patterns in c\u00e1ncer genomes. Proc Natl Acad Sci USA <strong>106:<\/strong> 21766-70<\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/www.pnas.org\/cgi\/doi\/10.1073\/pnas.0912499106\">http:\/\/www.pnas.org\/cgi\/doi\/10.1073\/pnas.0912499106<\/a><\/li>\n<li><a href=\"http:\/\/www.cancer.gov\/espanol\/pdq\/tratamiento\/melanoma\/Patient\/page1\">http:\/\/www.cancer.gov\/espanol\/pdq\/tratamiento\/melanoma\/Patient\/page1<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>Berger et al. 2012. Melanome genome sequencing reveals frequent <em>PREX2<\/em> mutations. Nature\u00a0<\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/www.nature.com\/nature\/journal\/vaop\/ncurrent\/pdf\/nature11071.pdf\">http:\/\/www.nature.com\/nature\/journal\/vaop\/ncurrent\/pdf\/nature11071.pdf<\/a>).<\/li>\n<\/ul>\n<p>Platz et al. 2008. Human cutaneous melanoma; a review of <em>NRAS<\/em> and <em>BRAF<\/em> mutation frequencies in relation to histogenetic subclass and body site. Mol Oncology <strong>1:<\/strong>395-405<\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/www.sciencedirect.com\/science\/article\/pii\/S1574789107001044\">http:\/\/www.sciencedirect.com\/science\/article\/pii\/S1574789107001044<\/a>.<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>\u00a0<\/strong><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Los avances obtenidos a trav\u00e9s del proyecto genoma humano y sus extensiones1, al igual que la aplicabilidad de tecnolog\u00eda de alta eficiencia, como por ej. el an\u00e1lisis de microarreglos2, en la evaluaci\u00f3n de la expresi\u00f3n gen\u00e9tica de cualquier tipo celular, por ej. c\u00e9lulas neopl\u00e1sicas, han sido de gran ayuda en la generaci\u00f3n del conocimiento necesario &hellip;<\/p>\n","protected":false},"author":57,"featured_media":26547,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[11,446],"tags":[],"class_list":["post-26546","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","","category-secciones-de-colaboradores","category-ventana-molecular"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/26546","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/users\/57"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=26546"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/26546\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/media\/26547"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=26546"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=26546"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/piel-l.org\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=26546"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}