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Evaluación del Transcriptoma psoriático

Esta semana el Profesor Felix J. Tapia, Adjunto del  Postgrado de Dermatología, Instituto de Biomedicina, Universidad Central de Venezuela, presenta el artículo titulado “Evaluación del Transcriptoma psoriático en una muestra grande: Genes regulados adicionales y comparaciones con los modelos in vitro” publicado en el J. Invest Dermatol, 2010;130:1829-1840. Los autores son Johann E Gudjonsson, Jun Ding, Andrew Johnston, Trilokraj Tejasvi, Andrew M Guzman, Rajan P Nair, John J Voorhees, Gonçalo R Abecasis y James T Elder.

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Los objetivos del estudio fueron: 1) Delinear el perfil de la expresión génica en psoriasis, comparando piel lesionada (PP), piel adyacente (PN) y piel normal (NN) en un grupo grande de pacientes; 2) Comparar los resultados con otros estudios publicados de microarray en psoriasis;3) Explorar si los mapas de trascritos publicados de queratinocitos en cultivo estimulados con citocinas representan las alteraciones observadas en PP.

Los resultados fueron los siguientes: 1) La comparación entre PP y NN identificó 1326 transcriptos de regulación diferentes, los cuales codifican 918 genes únicos (549 sobreregulados y 369 bajoregulados), 600 de los cuales fueron identificados por primera vez, incluyendo S100A7A, THRSP y ELOVL3; 2) Genes muy sobreregulados incluye SERPINB4, PI3, DEFB4, y varios miembros de la familia S100; 3) Genes muy bajoregulados incluye factor de inhibición 1 Wnt (WIF1), beta celulina (BTC) y CCL27.

El análisis permitió agrupar los genes en base a categorías de ontología. De esta manera se determinó que: Los genes sobreregulados  estaban asociados con respuesta inmunitaria, respuesta de defensa y diferenciación de queratinocitos;  Los bajoregulados con regulación de ácidos grasos y metabolismo de lípidos; La comparación del transcriptoma psoriático con el transcriptoma de queratinocitos estimulados con citocinas (IL-17, IL-22, IL-1a, IFN-g, TNF-a y OSM), mostró muy poca sobreposición con la expresión génica de queratinocitos estimulados con citocinas dando valores de 2,5, 0,7, 1,5, 5,6, 5,0 y 1,9% para el transcriptoma PP, respectivamente.

 

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